近日，瑞典烏普薩拉大學聯合華大集團旗下深圳華大生命科學研究院、華大基因智惠醫學研究院對1063例結直腸癌樣本進行了全基因組及轉錄組測序分析，發現了一系列與癌癥不同階段相關的基因，并識別了結直腸癌關鍵預后因子，為結直腸癌的預防、治療及預后都提供了數據基礎，相關研究于8月7日發表于全球頂級學術期刊《自然》（Nature）。這也是目前全球最大的結直腸癌多組學研究。

Nature官網截圖。

基因信息+臨床數據，雙劍合璧破解“癌癥密碼”

為了加深對結直腸癌發病機制的理解，識別驅動事件并確定其預后特征，中瑞兩國科研團隊針對瑞典知名癌癥樣本與數據庫U-CAN隊列中的1063例結直腸癌樣本進行了全基因組和轉錄組測序分析。1063例樣本中包括782例結腸癌和281例直腸癌，其中，21%（223例）為微衛星不穩定腫瘤（結直腸癌中的一種特定類型）。

從測序結果中，研究團隊鑒定得到了96個顯著突變基因，其中有24個為新發現的潛在驅動基因；另外，研究人員還發現，與WNT, EGFR 和 TGF-β 通路相關的驅動基因，也與結直腸癌生存顯著相關。

不止如此，研究人員還利用突變時序分析，推導出了9個與癌癥發生早期事件相關的驅動突變基因，和更傾向于在癌癥發生的后期階段出現的突變基因。這些發現為結直腸癌的早期檢測和靶向治療的開發提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉移相關的重要分子變化。

本次分析的結直腸癌樣本中，94%的病人有完整的5年臨床隨訪記錄，這也為研究人員更好地將基因數據與臨床數據進行結合，破解“癌癥密碼”提供了可能。

既往對結直腸癌基因相關的研究主要集中在編碼區突變，但其實非編碼區也可能會對癌癥發生發展造成影響。

本研究中，研究人員通過全基因組和轉錄組測序分析發現在線粒體基因組和非編碼區域中也存在與疾病相關的突變，并對與疾病進展顯著相關的突變進行了系統性的總結，這些突破性的發現填補了非編碼區在結直腸癌相關研究中的空白，將進一步推動對結直腸癌發病機制的理解。

論文作者、烏普薩拉大學的Tobias Sj?blom教授表示：“這項研究實現了迄今為止最大規模的結直腸癌基因組和轉錄組的綜合分析，并將分子層面的發現與高質量的臨床數據相結合，從而識別關鍵預后因子，這使這項研究有別于其他絕大多數癌癥基因組學的研究。U-CAN大規模的臨床患者隊列與華大杰出的測序及數據分析能力相結合，對于本項目的成功至關重要，我們期待未來能在這一科學領域與華大持續合作。”

論文作者、華大基因智惠醫學研究院林從博士表示：“此次通過將華大先進的基因組學技術和數據分析資源應用于大規模結直腸癌人群，不僅發現多種突變事件對預后的顯著預測效應，新構建的表達譜精細分型也將在未來指導結直腸癌個體化診療中發揮重要作用。期望未來能更加系統深入地解析不同腫瘤的發生發展機制，利用華大前沿技術探索開發更具臨床應用價值的標志物，真正實現腫瘤的早診早治。”（俞洋）

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